O Campus Universitário Prof. João Cardoso Nascimento Junior , dentro da estrutura da UFS, faz parte do Centro de Ciências Biológicas e da Saúde do Campus Prof. Aloísio de Campos em São Cristóvão. Portanto, as decisões sobre as atividades do Campus são discutidas e definidas no Conselho do Centro – que tem representação docente, discente e técnico-administrativa, além da presença de cada um dos chefes de Departamento e da Direção.
No Campus de Aracaju funcionam os cursos de Enfermagem, Medicina e Odontologia

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